Sau khi có quyết định thành lập Phân viện Nghiên cứu Khoa học Kỹ thuật Than, vào tháng 11 năm 1972, Đảng ủy Bộ Điện và Than quyết định thành lập Chi bộ Đảng Phân viện trực thuộc Đảng ủy Bộ Điện và Than gồm 15 đảng viên và chỉ định Ban Chi ủy lâm thời gồm 03 đồng chí Đảng ủy viên của Viện Quy hoạch và Thiết kế than là Nguyễn Danh Phiên (Bí thư), Nguyễn Mộng Hùng, Trần Trọng Kiên (chi ủy viên).
Ngày 23 tháng 4 năm 1973, chi bộ tổ chức Đại hội lần thứ nhất.
Tháng 9 năm 1977, Đảng ủy Bộ Điện và Than quyết định thành lập Đảng bộ bộ phận Phân viện gồm 03 chi bộ: Nghiên cứu, Thiết kế cơ khí và Nghiệp vụ.Tháng 4 năm 1988, Đảng bộ Viện chuyển về sinh hoạt theo địa phương nơi có trụ sở, là Đảng bộ huyện Gia Lâm và nâng lên là Đảng bộ cơ sở
Một buổi hợp BCH Đảng bộ Viện (2017)
Tháng 11 năm 1993, Đảng bộ Viện chuyển về trực thuộc Đảng bộ Khối Năng lượng Hà Nội (từ năm 1997, đổi tên là Đảng bộ Khối Công nghiệp Hà Nội) cho đến nay.
Tháng 6 năm 2010, Đảng bộ Viện Khoa học Công nghệ Mỏ đã tiến hành Đại hội Đảng bộ lần thứ XVIII, nhiệm kỳ 2010 – 2015 và bầu ra Ban Chấp hành Đảng bộ gồm 9 đồng chí, Bí thư Đảng ủy là đồng chí Lê Hồng Thắng, Phó Bí thư Đảng ủy là Viện trưởng Nguyễn Anh Tuấn.
Ngày 01 tháng 7 năm 2013, đồng chí Lê Hồng Thắng nghỉ hưu, từ ngày 26/6/2013, đồng chí Nguyễn Anh Tuấn là Bí thư Đảng ủy.
Tháng 6 năm 2014, đồng chí Nguyễn Anh Tuấn chuyển công tác đến Tập đoàn, là Phó Tổng Giám đốc TKV, TS. Trần Tú Ba được đề bạt là Viện trưởng và là Bí thư Đảng ủy Viện từ ngày 10/6/2014 đến ngày 31/5/2019
Đại hội Đảng bộ Viện lần thứ XIX, nhiệm kỳ 2015-2020 được tổ chức thành công ngày 26/5/2015. Đại hộ đã bầu ra BCH Đảng bộ nhiệm kỳ 2015-2020 gồm 9 đồng chí, đồng chí Trần Tú Ba là Bí thư và đồng chí Đào Hồng Quảng là Phó Bí thư.
Đại hội Đảng bộ Viện nhiệm kỳ 2010 – 2015
Ban Chấp hành Đảng bộ Viện, nhiệm kỳ 2015 – 2020
Ngày 11/5/2020, Đại hội Đảng bộ Viện lần thứ XIX, nhiệm kỳ 2020-2025 được tổ chức thành công. Đại hộ đã bầu ra BCH Đảng bộ nhiệm kỳ mới gồm 9 đồng chí, đồng chí Đào Hồng Quảng, Viện Trưởng là Bí thư, đồng chí Nhữ Việt Tuấn, Phó Viện Trưởng là Phó Bí thư. Hiện nay, toàn Đảng bộ có 198 đảng viên đang sinh hoạt ở 14 chi bộ và 1 Đảng bộ Bộ phận.
Ban Chấp hành Đảng bộ Viện, nhiệm kỳ 2020 – 2025
BCH Đảng bộ Viện Khóa XX, nhiệm kỳ 2020-2025 họp phiên đầu tiên
Trong những năm vừa qua, Đảng bộ luôn sát cánh cùng chính quyền, lãnh đạo thành công các định hướng chủ đạo và các nhiệm vụ hàng năm của Viện. Do vậy, Đảng bộ Viện luôn được Đảng ủy Khối Doanh nghiệp Hà Nội, Đảng Bộ Tập đoàn TKV đánh giá cao, hàng năm được công nhận là Tổ chức cơ sở Đảng trong sạch, vững mạnh tiêu biểu; đã được Thành ủy Thành phố Hà Nội tặng Cờ luân lưu, được Đảng ủy cấp trên trao tặng nhiều phần thưởng cao quý khác./.